旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因TsCystatin1的克隆及序列分析
为了研究旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂的功能,应用电子克隆的方法从GenBank EST数据库获得1个旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因(TsCystatin1)的部分cDNA序列,据此设计引物,并以旋毛虫新生幼虫总RNA为模板,进行反转录及PCR,克隆到该基因的完整开放阅读框序列,利用生物信息学软件对其进行了预测分析.结果表明,TsCystatin1 cDNA序列含有一个由666个核苷酸组成的开放阅读框架,编码由221个氨基酸残基组成的多肽,蛋白分子质量理论值为24.3 ku,理论等电点为4.44.TsCystatin1第1~25位氨基酸残基为信号肽序列,具有半胱氨酸蛋白酶抑制剂的保守序列QVVAG,其C末端具有3处N-糖基化位点以及4个链内二硫键所需的半胱氨酸残基.该蛋白的二级结构中α螺旋占18.6%,β折叠占23.5%,其余57.9%为转角.结构域分析表明,该蛋白具有一个半胱氨酸蛋白酶抑制剂样结构域,属于半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族2,与其他线虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂的同源性较高.
旋毛虫、半胱氨酸蛋白酶抑制剂、克隆、序列分析
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S852.731(动物医学(兽医学))
国家”十一五”科技支撑计划项目2007BAD40B03;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项0032007012;甘肃省科技重大专项0702NKDA039;教育部留学回国人员科研启动基金资助项目
2011-12-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
569-574