猪伪狂犬病病毒SL株gK基因的生物信息学分析

摘要：

对猪伪狂犬病病毒(PRV)四川分离株(SL株)gK基因进行分子克隆,并利用生物信息学软件对gK基因进行了同源性、遗传进化树、密码子偏向性、蛋白质二级结构预测及抗原表位分析.结果显示,成功克隆了PRV SL株gK全基因,其编码区长939 bp,编码313个氨基酸残基,与其他PRV分离株核苷酸序列同源性为97.6%～99.9%,与国外分离株的同源性略高于国内分离株.gK基因存在4个跨膜区及1个明显的CpG岛.表明成功克隆了PRV SL株gK基因,该基因具有潜在的抗原性.

关键词：伪狂犬病病毒、gK基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：40

分类号：S852.659.1(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家科技支撑计划项目2006BAD06A18;教育部”长江学者和创新团队发展计划”项目IRT0848

在线出版日期：2011-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1002-1006