用于检测仔猪致病菌的23 S rRNA基因芯片的研制

摘要：

以副猪嗜血杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠道沙门氏菌、猪链球菌等12种仔猪致病菌为目标细菌,23 S rRNA基因为靶基因,从GenBank中下载其23 S rDNA全序列,在其变异区设计特异性探针,在保守区设计通用引物.通过序列分析、PCR靶标与探针杂交试验,建立了有13条寡核苷酸探针和2对通用引物的仔猪常见致病菌基因芯片检测方法.以参考菌株粗提基因组DNA的10倍系列稀释模板做PCR,扩增产物与探针杂交,检出芯片的灵敏度为100 fg.对33个参考菌株用芯片检测,结果有1例不正确,只鉴定到属;在61个野外分离株中,55株的芯片检测结果与生化或测序结果一致,有6例不一致,符合率为90%.初步研究证明,该检测方法能快速、有效地鉴定多种仔猪常见致病菌,但要区分某些细菌的致病株与非致病株,还要检测毒力/毒素基因.

关键词：仔猪、致病菌、23S rRNA基因、芯片、寡核苷酸探针

所属期刊栏目：40

分类号：S858.25;Q81(动物医学（兽医学）)

资助基金：北京市科技合同项目Z0006321000191

在线出版日期：2010-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：258-264