鸭瘟病毒UL24基因的分子特征分析

摘要：

根据本实验室获得的鸭瘟病毒的一段基因序列设计引物,利用PCR扩增UL24基因并克隆到pMD18-T载体,阳性重组质粒进行酶切鉴定、测序验证与生物信息学分析.结果显示,获得的UL24基因全长1 230 bp,编码409个氨基酸;与其他26株疱疹病毒科中α-疱疹病毒亚科的UL24基因的相似性较β和γ亚科高,其中与α亚科禽疱疹病毒属中的GaHV-3相似性最大(34.7%);遗传进化树显示,该基因编码的蛋白与火鸡疱疹病毒的UL24蛋白的亲缘性最近.该蛋白是一种保守但不舍信号肽的外膜蛋白,具有5个潜在的N-糖基化位点和19个磷酸化位点;编码的氨基酸Ala,Apn,Glu,Phe,Leu,Arg,Thr,Val具有一定的偏嗜性.二级结构分析显示,α螺旋和无规卷曲含量高,均达46.94%,而β折叠仅占6.11%;同源建模比对,未发现与之匹配的三级结构;预测的抗原表位主要位于肽链第36～48、241～323、344～379位区段.

关键词：鸭瘟病毒、UL24基因、分子特征、生物信息学分析

所属期刊栏目：39

分类号：S852.659.1(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目30771598;教育部"长江学者和创新团队发展计划"创新团队项目PCSIRT0853;教育部"新世纪优秀人才支持计划"项目NCET-06-0818;教育部"高等学校科技创新工程重大项目培育资金"项目706050;四川省杰出青年基金项目07ZQ026-132;四川省基础研究重大项目07JY029-016/07JY029-017;四川省教育厅重大项目07ZZ028/07ZA051;四川省重点建设学科项目SZD0418

在线出版日期：2009-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：110-118