基于生物信息学鉴定与子宫内膜癌免疫微环境相关的预后标记物

摘要：

目的 基于生物信息学方法鉴定子宫内膜癌(UCEC)新的生物标记物,并分析UCEC中免疫微环境的变化情况.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)下载UCEC基因表达谱数据集,通过CIBERSORT、ESTIMATE等方法评估混合细胞群体中UCEC表达谱矩阵中免疫细胞成员的丰度和分布.计算体细胞突变样本数据的肿瘤突变负荷(TMB)值,并分析其与生存率的关系.通过重叠分析获得与UCEC免疫微环境和TMB相关的靶基因,然后基于多种肿瘤类型的样本数据进行靶基因的泛癌分析,验证其在多种肿瘤中的共性.利用GSEA研究了UCEC中靶基因的生物学功能.结果 免疫细胞浸润分析表明肿瘤相关巨噬细胞包括滤泡辅助T细胞、调节T细胞、M0巨噬细胞和浆细胞可能在UCEC发展中发挥了重要作用.免疫微环境变化及肿瘤突变负荷与UCEC病理分级、生存率相关.筛选出与免疫微环境关系最密切的CXC趋化因子配体14(CXCL14),其低表达富集会抑制错配修复、细胞凋亡等通路.结论 肿瘤免疫微环境变化与UCEC发展密切相关,CXCL14可作为UCEC有效的免疫相关预后标志物.

关键词：子宫内膜癌、生物信息学、肿瘤浸润免疫细胞、趋化因子CXCL14、预后标志物

所属期刊栏目：33

分类号：R71(妇产科学)

资助基金：湖北省卫生健康委员会科研项目WJ2018H175

在线出版日期：2022-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：463-469