10.13422/j.cnki.syfjx.20221015
基于叶绿体DNA序列和ISSR分子标记的菘蓝不同种质遗传变异分析
目的:对47个菘蓝种质进行序列变异和遗传多样性分析,开展其遗传分化和遗传结构研究.方法:采用试剂盒提取法提取菘蓝基因组DNA,用2条叶绿体DNA(cp DNA)序列和5条简单重复序列(ISSR)引物进行扩增并测序,通过软件Chromas、Mega7.0、DanSP5、GenALEx对得到的序列进行校正、拼接及序列特征分析,利用软件PERMUT、PopGen1.31进行遗传多样性参数和遗传结构分析,最后利用NTSYS软件得到47个菘蓝种质的非加权组平均法(UPGMA)聚类树状图.结果:菘蓝47个种质的129个样本被成功扩增和测序,2个cp DNA序列经拼接后长度为1412 bp,共有377个多态性变异位点,单倍型数为36个,Fu and Li's D*检验在P＜0.01水平上显著;基于cp DNA的核苷酸多样性(Pi)、平均遗传多样性(Hs)和总遗传多样性(HT)分别为0.119 89、0.787和0.891,遗传分化系数遗传分化系数(Gst)、核苷酸分化系数(Nst)和群体间遗传分化指数(Fst)分别为0.117、0.468和0.488,基因流(Nm)值为0.615;基于ISSR的多态位点百分率(PPB)、香农(Shannon)信息多样性指数(I)、Nei's基因遗传多样度指数(H)和Gst平均值为78.85％、0.334 8、0.218 6和0.754 4,NM值为0.162 8.结论:菘蓝在物种水平上遗传多样性较高,具有丰富的单倍型类型,不同种质居群间遗传分化较明显,且基因交流不频繁,遗传变异主要存在于居群间,种群近期积累了较多的低频基因突变,推测其历史上曾经历了显著的区域扩张.
菘蓝、种质、叶绿体DNA(cp DNA)、简单重复序列(ISSR)分子标记、遗传变异
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R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)
道地药材生态种植;质量保障项目;中国工程院战略研究与咨询项目;中央本级重大增减支项目;甘肃省重点研发计划项目;甘肃省重点研发计划项目;定西市科技计划项目
2022-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
117-126
