10.13422/j.cnki.syfjx.20221011
基于ITS2序列的乌头属药材分子鉴定及亲缘关系分析
目的:应用核糖体基因内转录间隔区(ITS)2序列对乌头属12种药材进行DNA条形码(DNA barcoding)分子鉴定,并确定其亲缘关系.方法:收集乌头属12种药材共计30份,运用离心柱型植物基因组试剂盒的方法提取DNA、使用ITS2序列通用引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增、电泳检测后双向测序,应用CodonCode Aligner 17.0软件对测序序列和峰图进行校对拼接,利用MEGA 7.0软件进行序列变异分析,采用ITS2 Database在线工具预测其二级结构,使用邻接法(NJ)构建系统聚类树.结果:乌头属12种药材ITS2序列长度为220～221 bp,鸟嘌呤和胞嘧啶(GC)平均含量为64.09％;变异位点共140个,信息位点共137个,保守位点共81个,种内遗传距离(K2P)小于种间K2P;在ITS2序列二级结构和NJ聚类分析中,花葶乌头、西伯利亚乌头和高乌头的亲缘关系接近,其他9种药材的亲缘关系接近,其中华北乌头和阴山乌头的亲缘关系更为接近.结论:ITS2序列在乌头属12种药材分子鉴定及确定亲缘关系方面具有较好的应用价值,为民族药的资源保护、开发应用方面提供新的思路、技术和方法.
乌头属、内转录间隔区(ITS)2序列、二级结构和邻接法(NJ)聚类分析、DNA条形码、分子鉴定
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R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)
国家重点研发计划;内蒙古自治区科技重大专项;内蒙古自然科学基金项目;蒙药研发国家地方联合工程研究中心开放基金项目;内蒙古民族大学研究生科研创新资助项目
2022-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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