10.13422/j.cnki.syfjx.20220915
基于cp DNA的当归野生与栽培种质鉴定与遗传变异分析
目的:基于叶绿体基因(cpDNA)对甘肃省11个当归栽培品种(系)及7个野生当归居群进行了遗传变异分析,为当归的种质鉴定和新品种的选育提供参考.方法:利用3对cpDNA引物对当归样品进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并测序,利用MegaX软件对序列特征进行统计,并计算当归居群间平均遗传距离,利用NTSYS2.10e软件构建遗传距离非加权组平均法(UPGMA)聚类图.利用DanSPv6软件计算当归序列多态性及Tajima中性检验;利用PERMUT软件计算当归居群结构;利用Arlequinv3.5软件进行分子变异分析;最后利用PopART1.7软件构建TCS单倍型网络图.结果:3对cp DNA引物扩增、测序、比对、合并后的序列长度为1 759 bp,野生当归检测到1个变异位点,栽培当归检测到480个变异位点,其中单一突变位点97个,简约信息位点383个,插入-缺失位点152个.在野生组和栽培组当归cp DNA的matK、psbA-trnH和rbcL 3个区域中,多态性最高的区域均为matK.全部当归联合序列的Tajima中性检验均为不显著负值,但在栽培当归中psbA-trnH和rbcL基因中呈显著负值,说明当归整体上遵循中性进化,而psbA-trnH和rbcL基因经历过选择.野生居群间的遗传分化程度(Fst=0)低于栽培当归居群间的分化程度(Fst=0.114 19,P＜0.05),且二者之间遗传分化程度较高(Fst=0.942 55,P＜0.01).栽培当归居群中变异主要来源于居群内部(89％).遗传距离UPGMA聚类树显示野生当归和栽培当归各自聚为一支,亲缘关系较远,栽培当归中居群3距离其他栽培当归居群较远.TCS单倍型网络图由15个单倍型和4个未知单倍型构成,分为3部分,各部分间变异次数较多,共享单倍型仅分布于野生或栽培组之内,组间不存在共享单倍型.结论:当归在物种水平上遗传多样性偏低,野生当归居群多样性低于栽培当归,野生与栽培当归组间的遗传分化程度高,而野生当归居群内和栽培当归居群内的分化程度均较低,栽培当归中遗传变异主要存在于居群内.
当归、叶绿体基因(cpDNA)、野生、栽培、遗传变异
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R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)
甘肃省科技厅创新基地和人才计划;道地药材生态种植;质量保障项目;甘肃省教育厅双一流科研重点项目;甘肃中医药大学科学研究与创新基金项目;中国工程院战略研究与咨询项目
2022-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
129-138
