基于网络药理学和实验验证探讨新疆紫草治疗黑色素瘤的分子机制

摘要：

目的:通过网络药理学及分子对接技术初步预测新疆紫草治疗黑色素瘤的活性成分、作用靶点及信号通路,通过体外实验验证可能的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP),成分靶点预测数据库(SwissTargetPrediction)以及查阅文献获取新疆紫草药理作用的活性成分及相关靶点;通过GeneCards,在线人类孟德尔遗传病数据库(OMIM),毒性与基因比较数据库(CTD)获取黑色素瘤相关靶点;使用STRING数据库构建活性成分与相关靶点的新疆紫草-黑色素瘤靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图;利用Cytoscape 3.8.2软件对新疆紫草抗黑色素瘤网络节点进行筛选分析;使用DAVID 6.8数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.选取新疆紫草中活性成分乙酰阿卡宁和靶点通过AutoDock vina 1.1.2软件进行分子对接验证;利用体外细胞实验验证药物抗黑色素瘤的作用.结果:预测显示,新疆紫草与黑色素瘤共同靶点271个,其中关键靶点23个,包括基质金属蛋白酶(MMP)-9,Janus激酶(JAK)2等;KEGG富集分析预测新疆紫草治疗黑色素瘤主要作用于JAK信号转导与转录激活蛋白(STAT),酪氨酸激酶受体(ErbB),血管内皮生长因子(VEGF)等信号通路;分子对接显示新疆紫草中活性成分乙酰阿卡宁与JAK2,STAT3,VEGF,MMP-9,上皮钙黏蛋白(E-cadherin)受体表现出良好的对接活性;体外蛋白免疫印迹与实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)结果表明,不同剂量的乙酰阿卡宁能抑制A375细胞JAK2,STAT3,VEGF,MMP-9,E-cadherin蛋白与基因的表达(P＜0.05).结论:新疆紫草治疗黑色素瘤具有多靶点、多通路的特点,其发挥治疗作用机制可能与影响JAK2,STAT3,VEGF,MMP-9,E-cadherin等关键靶点蛋白的表达,进而抑制黑色素瘤细胞侵袭和转移能力有关.该研究为新疆紫草抗肿瘤提供了实验依据.

关键词：新疆紫草;黑色素瘤;网络药理学;分析对接;体外验证

所属期刊栏目：28

分类号：R285;R965;R289;R22;R2-031;R33(中药学)

资助基金：新疆维吾尔自治区科技支疆项目2018E02069

在线出版日期：2022-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：204-211