基于SSR分子标记的灯盏花遗传多样性分析

摘要：

目的:研究灯盏花Erigeron breviscapus居群遗传多样性,为灯盏花资源的合理利用与保护提供科学依据.方法:采用12对简单重复序列(SSR)分子标记对灯盏花16个野生居群共243个样品进行遗传多样性研究,计算遗传多样性参数,并进行主坐标分析和结构聚类分析.结果:共检测到209个等位基因,平均每个位点的等位基因数为17.417个;基于12对SSR引物和16个灯盏花居群,观测杂合度(H0)分别为0.603,0.613,期望杂合度(He)分别为0.658,0.659,香浓(Shannon)信息指数(Ⅰ)分别为1.443,1.446,遗传分化系数(Fst)0.123,基因流(Nm)2.077;分子方差分析(AMOVA)与遗传分化分析结果显示主要变异来源于居群内个体间变异;居群间遗传距离和遗传一致度分别为0.107(YA和XY)～0.713(SZ和XZD),0.490(SZ和XZD)～0.899(YA和XY);主坐标分析和结构聚类分析分别将16个居群分为2组.结论:SSR分子标记结果显示,灯盏花居群遗传多样性较高,居群内和居群间具有一定的遗传分化和Nm;遗传变异主要存在于居群内个体间.该实验结果可为灯盏花后续的优良种质选育等研究提供参考依据.

关键词：灯盏花;简单重复序列(SSR)分子标记;遗传多样性;遗传结构;主坐标分析;聚类分析

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分类号：R284.2;R289;R22;R2-031;R33(中药学)

资助基金：云南省应用基础研究——中医联合面上项目;云南中医药大学中药学院学科建设专项;云南省中青年学术技术带头人后备人才项目;云南省高层次人才培养支持计划"青年拔尖人才"专项

在线出版日期：2021-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：136-143