10.13422/j.cnki.syfjx.20202115
中药火麻仁基原植物大麻全基因组YABBY转录因子分析
目的:分析大麻(Cannabissativa)YABBY转录因子家族序列特征、染色体定位、基因结构、保守基序、系统进化和基因的差异表达;为深入研究YBBY基因功能提供分子基础,为工业大麻优良品种选育提供理论支撑.方法:通过生物信息学手段对火麻仁基原植物大麻YABBY基因家族进行鉴定和分析,使用PlantTFDB,ExPASy,MEME,WoLFPSORT,PLANTCARE等在线网站及TBtools,MEGA,DNAMAN等软件进行YABBY预测和分析并进行可视化作图.结果:大麻中含有6个YABBY基因成员,分布在5条染色体上,其中5个定位在细胞核,1个定位在胞外;氨基酸数目185～235个,等电点介于5.05和9.34,相对分子质量在20 582.45～26 282.7 Da;所有CsYABBY蛋白都包含有锌指结构和YABBY两个保守结构域,CsYABBY基因启动子区具有多种与胁迫相关的顺式作用元件,并且在不同部位和不同品种的表达量存在差异.结论:该基因家族的表达可能会受到激素和外界环境因素影响,大麻YABBY基因具有组织表达特异性,花中特异性高表达的基因可能对大麻雌花的发育有重要调控作用,YAB1和YAB5亚族的CsYABBY可能参与大麻素的合成过程.
生物信息学、大麻、YABBY基因、保守分析、进化分析
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R284.2;R289;R22;R2-031(中药学)
国家重点研发计划;国家自然科学基金;专家服务基层重点服务项目
2021-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
124-131
