光果甘草ARPI基因的克隆和生物信息学分析

摘要：

目的:克隆光果甘草生长素/吲哚乙酸蛋白(Aux/IAA) (GgARPI)基因并进行生物信息学分析.方法:取光果甘草新鲜主根,提取RNA,通过逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)克隆GgARPI基因互补脱氧核糖核酸(cDNA)序列,测序并对其进行生物信息学分析.结果:克隆得到长度为686 bp的GgARPI基因cDNA序列,包含1个585 bp的完整开放阅读框(ORF),编码194个氨基酸残基.生物信息学分析表明GgARPI编码蛋白为稳定亲水蛋白,相对分子质量21.95 kDa,等电点6.85,不含信号肽,无跨膜区,二级结构以无规卷曲为主,包含1个Aux/IAA蛋白超家族结构域.同源性分析表明GgARPI基因与豆科植物的亲缘关系较近,与单子叶植物谷子Setaria italica的进化关系最远.结论:首次克隆得到GgARPI cDNA序列,为进一步研究GgARPI基因的功能及其对甘草酸生物合成的分子调控机制奠定了基础.

关键词：光果甘草、生长素响应蛋白、生长素/吲哚乙酸蛋白、甘草酸、生物信息学、开放阅读框、GgARPI基因

所属期刊栏目：26

分类号：R22;R28;R931;Q78;R318(中医基础理论)

资助基金：国家自然科学基金81503181

在线出版日期：2020-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：185-190