10.13422/j.cnki.syfjx.20190917
铁棍山药SUS基因CDS区克隆与生物信息学分析
目的:对铁棍山药蔗糖合成酶(sucrose synthase,SUS)基因的编码区域(coding sequence,CDS)进行克隆和蛋白质结构分析,为该基因的调控机制与山药多糖的合成机制提供理论依据.方法:提取铁棍山药总RNA并反转录为cDNA第一链,根据本实验室铁棍山药基因组数据经注释得到的SUS基因序列设计一对特异性引物,利用基因克隆技术获得SUS基因的编码区域并通过蛋白质预测分析软件分析蛋白质序列特征.结果:克隆得到一个长度2 448 bp的基因序列,具有一个完整的开放阅读框架(open reading frame,ORF),命名为DoSUS1.DoSUS1的分子式为C4209 H6534N1115O1205S23,相对分子质量9 788.32,共815个氨基酸,理论等电点(PI)6.10,消光系数为110 505,脂溶性指数(AI)为94.15,不稳定指数为32.18,平均亲水指数(GRAVY)为-0.225,属于稳定可溶性酸性蛋白质.DoSUS1氨基酸序列存在多个磷酸化位点,不存在跨膜区与信号肽.蛋白质二级结构与三级结构结果显示DoSUS1属于全α类蛋白质.功能域预测结果显示DoS US1有蔗糖合成与糖基转移两个功能域.同源性比对结果显示DoSUS1的氨基酸序列与所比对单子叶植物的氨基酸序列相似性均＞80％.系统进化树显示DoSUS1与单子叶植物的SUS进化关系较近.结论:首次从铁棍山药中克隆出SUS基因的编码序列,并对其蛋白质结构进行了分析,为进一步阐明SUS在山药生长发育和多糖合成机制中的作用奠定了基础.
铁棍山药、蔗糖合成酶基因、基因克隆、编码区域、生物信息学
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R284.1;R289;R22;R2-031(中药学)
现代农业产业技术体系;河南省科技攻关计划
2019-05-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
136-143
