参附注射液作用机制的计算机系统生物学分析

摘要：

目的:参附注射液是传统中药红参与附子的复方制剂,临床主适应症为充血性心力衰竭、缺血性脑卒中等.以缺血性脑卒中为导向,采用系统生物学和实验研究方法,对参附注射液调节生物学网络的分子机制做一阐释.方法:以参附注射液的28个成分出发,分别从TCMGeneDIT数据库系统和Agilent literature search系统中挖掘参附注射液中成分作用的蛋白质数据,并辅助以Pharmmapper反向对接靶标,构建参附注射液多成分-蛋白网络,在Genecards,BIND,BioGRID,IntAct,Mint 等数据库中挖掘蛋白之间关联,建立蛋白相互作用网络.提取显著性差异蛋白子网络一个,并对其中通路以Western blot蛋白印迹方法加以验证.结果:参附注射液成分与55个蛋白有连接,构成53个无孤立结点的蛋白相互作用网络.应用ClusterOne 模块对蛋白相互作用网络富集分析,提取显著性差异P ＜0.05的子网络1个,子网络中含有关键蛋白15个,经Biocart信号通路映射,涉及NF-κB信号通路,AKT信号通路,Toll样受体信号通路,MAPK信号通路等.采取Western blot方法对富集指数P值最小的NF-κB信号通路进行验证,发现参附注射液在缺血1h再灌注24 h的MCAO模型上对NF-κB p65和IκB-α的磷酸化表达有明显下调作用.结论:采用计算机系统生物学和实验验证方式初步阐释了参附注射液主要化合物防治疾病的分子机制,并以分子生物学实验方式对所预测的信号通路进行验证,为中药复方的系统研究提供参考.

关键词：计算机系统生物学、参附注射液、作用机制、信号通路、网络、大脑中动脉栓塞模型

所属期刊栏目：21

分类号：R287.6;R945;R944.1(中药学)

资助基金：江西省卫生厅课题20155144

在线出版日期：2015-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：217-221