基于转录组学探讨阿比朵尔对HCoV-OC43感染诱导神经营养因子信号通路活化的影响

摘要：

目的 采用转录组学技术分析阿比多尔(arbidol,ARB)对HCoV-OC43 感染引起宿主信号通路活化的影响,并探讨ARB抗炎活性与其作用于神经营养因子信号通路的关系.方法 用OC43 感染HRT-18 细胞,并以ARB进行干预.感染 96 h后提取总RNA,进行转录组学分析,获得差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),开展基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,筛选出ARB可能作用的生物学过程及相关信号通路.进一步利用RT-qPCR方法验证ARB干预对神经营养因子信号通路关键分子表达的抑制作用.结果 与病毒感染组相比,高、中和低剂量(6、2 和 0.67 μg/mL)ARB干预分别显示出 9459、4186 和 1744 个DEGs.GO分析显示,ARB主要干预的生物学过程是共翻译蛋白膜靶向,作用的细胞组成为粘着斑和细胞-底物间连接,影响的分子功能为钙粘蛋白结合.KEGG分析发现,与冠状病毒感染相关的细胞凋亡信号通路和神经营养因子信号通路有明显富集,其中ARB对神经营养因子信号通路中的MAPK、PI3K和NF-κB通路分子有显著抑制作用.RT-qPCR检测显示,ARB对 PIK3CA、AKT、TRAF-6、Bax、p38 和 c-JUN 等分子的 mRNA 表达具有明显抑制作用.结论 本研究提示了ARB应用于治疗冠状病毒感染引起神经炎症的可能性.

关键词：转录组学、阿比多尔、HCoV-OC43、神经营养因子信号通路

所属期刊栏目：33

分类号：R-33(医学研究方法)

资助基金：广东省防控新型冠状病毒感染科技攻关应急专项;东莞市新型冠状病毒肺炎防疫防治技术研究;推广应急攻关专项项目;广东省基础与应用基础研究基金;广东省基础与应用基础研究基金;东莞市人民医院院内项目;东莞市人民医院院内项目

在线出版日期：2023-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：81-89