近交系小鼠双色荧光正相杂交芯片技术体系的建立和优化

摘要：

目的 探讨采用单核苷酸多态性(SNP)检测方法-双色荧光正相杂交芯片技术对近交系小鼠遗传质量监测及相关影响因素.方法 运用基于芯片的双色荧光正相杂交检测SNP技术,进行芯片杂交动力学研究,考察信号值(Cy3,Cy5)和ratio值(Cy5/Cy3)与PCR产物点样浓度、PCB产物长度和荧光标记探针长度之间的关系,研究PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度对SNP分型的影响.结果 采用正反标记实验后,Ratio值随着PCR产物点样浓度的增加呈稳定趋势;PCR双链产物长度对信号值影响比较大,点样时其长度不宜太长,最好不超过450 bp;随荧光标记探针长度的增加,基因分型能力明显下降,长度为15 bp最佳,长度超过20 bp时,已基本没有区分能力.结论 PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度是双色荧光正相杂交SNP分型系统的重要影响因素,采取适当的PCR产物点样浓度、PCR产物长度和荧光标记探针长度,并采用正反标记实验,可以取得稳定、准确的基因分型效果.为进一步进行近交系小鼠遗传质量监测的研究奠定基础.

关键词：单核苷酸多态性、芯片、双色荧光杂交、小鼠

所属期刊栏目：18

分类号：R-33(医学研究方法)

资助基金：上海市科技发展基金044909004

在线出版日期：2008-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：18-23,插4-,插5