基于转录组测序研究CatSper1在版纳微型猪近交系睾丸组织中的转录调控特征

摘要：

目的 CatSper1是精子特定的电压门控Ca2+通道蛋白,在精子生成和受精过程中具有重要作用.本研究旨在分析CatSper1基因在版纳微型猪近交系(BMI)的表达调控模式、序列特征与潜在的生物学功能.方法 取成年BMI公猪睾丸进行转录组测序;采用RT-PCR技术克隆CatSper1的完整编码序列;分析CatSper1的序列、结构特征及相互作用蛋白;利用转录组测序数据构建CatSper1的lncRNA和miRNA调控网络,并进行GO功能注释.结果 RNA-seq获得CatSper1基因的平均表达量和平均TPM值分别为2817.5和33.6.CatSper1 CDS区全长为2166 bp(GenBank登录号:OK042306),编码721个氨基酸,含有233个氨基酸残基组成的Ion_trans保守结构域以及与精子生成相关的保守跨膜螺旋结构.CatSper1蛋白与10个雄性育性相关蛋白质存在相互作用,尤其与该基因家族成员CatSper2-4蛋白互作最为紧密.CatSper 1基因受10个miRNAs靶向调控,分别有16个和14个lncRNAs与CatSper1竞争性结合ssc-miR-1343和ssc-miR-744.GO注释发现CatSper1基因在分子功能(MF)、生物学过程(BP)、细胞成分(CC)等方面均具有重要功能.结论 本研究报道了CatSper1在BMI睾丸中的表达,基因的分子结构特征和表达调控网络,为深入研究CatSper1基因在BMI精子发生、精子获能和顶体反应等重要生物学过程中的功能奠定了基础.

关键词：版纳微型猪近交系、阳离子通道精子相关蛋白1、转录组测序、精子生成、转录调控

所属期刊栏目：30

分类号：Q95-33(动物学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;吕梁学院博士科研启动基金项目

在线出版日期：2022-11-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：619-628