基于RIP-Seq技术检测MRTF-A结合RNA在小鼠MCAO/R模型中表达

摘要：

目的 应用RIP-Seq测序技术检测小鼠MCAO/R模型中心肌素相关转录因子A(MRTF-A)结合RNA的表达差异,探讨MRTF-A潜在的作用机制.方法 将C57BL/6小鼠随机分成假手术组及I/R组,线栓法构建MCAO模型,再灌注24 h后,提取脑组织总蛋白,利用MRTF-A抗体免疫共沉淀后,进行RNA高通量测序,获得MRTF-A结合RNA的表达谱,继而对差异RNA进行GO、KEGG分析.结果 与假手术组相比,I/R组有429个RNA发生差异表达(上调203,下调226),并且在功能元件和染色体分布上均具有显著差异.GO分子功能分析显示,差异表达RNA主要富集RNA结合、Poly(A)RNA结合等注释.KEGG通路分析显示10条通路被显著富集,其中雌激素信号通路富集最显著.结论 在脑I/R损伤时MRTF-A结合RNA表达谱发生差异改变,为深入探讨MRTF-A的分子机制提供理论依据.

关键词：心肌素相关转录因子A、RNA结合蛋白免疫共沉淀-高通量测序、脑缺血再灌注损伤、差异基因分析

所属期刊栏目：28

分类号：Q95-33(动物学)

资助基金：国家自然科学基金;湖北省自然科学杰出青年基金;湖北省卫生计生委科研项目

在线出版日期：2021-01-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：765-772