基于高通量测序技术测定普通棉耳狨猴 粪便微生物多样性

摘要：

目的 应用高通量测序技术分析普通棉耳狨猴粪便菌群的结构与组成,为进一步开发利用新型实验动物奠定基础.方法 采集4只成年雄性普通棉耳狨猴粪便,用细菌16S rRNA通用引物扩增V3～V4区,采用Illumina MiSeq测序平台对普通棉耳狨猴粪便微生物进行研究.结果 共测序获得315511条有效序列与596个OTU.普通棉耳狨猴粪便中的细菌共鉴定出9个门、14个纲、26个目、50个科、82个属和64个种和226个OTU.其中,1)优势门是拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),平均含量分别为54.52％ 和25.39％2)丰度最高的纲为拟杆菌纲(Bacteroidia)和厌氧菌纲(Negativicutes),平均含量为54.5％和17％.3)乳杆菌目(Lactobacillales)和拟杆菌目(Bacteroidales)的丰度最高,为50.01％和20.52％.4)普雷沃菌科(Prevotellaceae)和双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)所占丰度最高,平均含量分别为43.14％和11.33％.5)双歧杆菌属(Bifidobacterium)和拟杆菌属(Bacteroides)的丰度较高,平均含量分别为11.33％11.12％.6)有益菌群双歧杆菌属丰度较高,但在所检测样本中都含有.7)丰度最高的前10个种,归类为7个科、5个纲.这10个种占到33.16％,其他53种总和仅占到0.74％,其他未鉴定出菌种,且相对丰度还较高,需要进一步研究.8)PICRUSt功能预测分析:氨基酸转运等代谢功能和蛋白质翻译、折叠遗传信息处理功能丰度较高.结论 应用高通量测序技术,较全面的检测了普通棉耳狨猴粪便菌群,普通棉耳狨猴粪便细菌组成具有丰富的多样性,其中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的细菌,需要进一步研究.

关键词：普通棉耳狨猴、粪便、高通量测序、物种组成、优势菌群

所属期刊栏目：27

分类号：Q95-33(动物学)

在线出版日期：2019-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：366-373