利用表达谱芯片数据筛选不同表达丰度的内参基因

摘要：

目的 基于表达谱芯片的检测结果,筛选多个内参基因,用于小家鼠肝脏组织中具有不同表达丰度基因的定量检测.方法 应用表达谱芯片技术,完成小鼠肝脏组织的表达谱检测;依据基因表达丰度将基因分为3组,并进一步通过变异系数(coefficient of variation,CV)组内筛选候选内参基因;采用实时荧光定量PCR技术(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)和geNorm软件确定内参基因.结果 表达谱芯片成功采集超过60000个小鼠肝脏组织中转录本的表达量数据,并将之分为低、中、高3个组合.最终筛选了低表达Casp2和Lr?rc14、中表达Nrd1和Trpc4ap、高表达Atp5a1和Clu,共6个内参基因.结论 基于表达谱芯片数据筛选的6个内参基因,可适用于qPCR技术准确定量小家鼠肝组织转录组中不同表达丰度基因的表达量.

关键词：内参基因、表达谱芯片、实时荧光定量PCR、geNorm软件

所属期刊栏目：25

分类号：Q95-33(动物学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目31371257;上海市科委关键项目12140900404,13140900300,15140900500

在线出版日期：2017-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：8-13