斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析

摘要：

目的：了解斑马鱼核纤层蛋白（ lamins）的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列，利用ClustalX工具进行分析，并用MEGA 4?0软件绘制进化树；通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比，最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息，进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高，推断lmna、lmnb1和lmnb2基因在进化过程中高度保守。结论编码斑马鱼lamins的基因lmna、lmnb1和lmnb2等可能是人类LMNA、LMNB1和LMNB2等基因的直向同源物。

关键词：斑马鱼、核纤层蛋白、lmna基因、进化树、共线性分析

所属期刊栏目：24

分类号：Q95-33(动物学)

资助基金：国家自然科学基金编号31260284。

在线出版日期：2016-10-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：351-357