五种啮齿类动物mtDNA蛋白编码基因序列变化的比较

摘要：

目的 利用本实验室测定的中国地鼠、金黄地鼠和GenBank中田鼠、小鼠、大鼠的线粒体全基因组序列,比较分析五种啮齿类动物的mtDNA蛋白编码基因序列的变异,探讨其分子进化关系.方法 将五种动物各自的13个蛋白编码基因分别连接成一个序列,用DNAstar-EditSeq分析软件计算每个序列的碱基长度和组成,计算蛋白编码基因的碱基和氨基酸的差异.以人为外群,基于连接在一起的13个蛋白编码基因的氨基酸序列,用MEGA4.0软件通过最大简约性法(MP)和非加权成对平均数法(UPGMA)构建进化树.结果在五种啮齿动物的13个蛋白基因序列中,A、T、C、G碱基的平均含量为32.4 %、29.6 %、26.2 %和11.9 %,中国地鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列与其他物种相比,与金黄地鼠的相应序列差异最小,与大鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列差异较大.分子进化树也显示中国地鼠和金黄地鼠的亲缘关系最近,与小鼠、大鼠存在的差异相对大.结论 五种动物的碱基组成的百分比中显示G的相对缺乏,相互之间的进化关系与传统的分类地位基本吻合.

关键词：啮齿类、线粒体DNA、蛋白编码基因、变异、分子进化

所属期刊栏目：21

分类号：Q95-33(动物学)

资助基金：山西省自然科学基金2012011034-1;山西省实验动物专项资金资助2009K01;山西医科大学科技创新基金资助01200903

在线出版日期：2013-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：70-74