巴马香猪Toll样受体4基因cDNA的克隆及生物信息学分析

摘要：

目的 研究TLR4在猪自然免疫中的作用及机制,为抗病育种及免疫佐剂的开发提供依据.方法 利用NCBI公布的TLR4基因序列设计引物,RT-PCR技术克隆巴马香猪TLR4基因.结果 所得基因序列提交GenBank,登录号:GQ304754.经序列分析,发现巴马香猪TLR4基因开放阅读框长2526 bp,编码785个氨基酸,该蛋白等电点为6.58,分子量为96.4×103;与普通猪比对发现巴马香猪TLR4基因有5个碱基发生突变;与小鼠、狗、鸡、牛、羊和人的同源性分别为71.9%、81.5%、54.2%、86.4%、85.5%和81.9%;TLR4膜外区蛋白为背侧多个α螺旋和内侧多个β折叠平行交替排列构成一个弯曲状螺旋结构;N末端存在信号肽,且可能在23～24位氨基酸处存在裂解位点;胞外区有13个明显的LRR,分别位于第53～74、77～100、101～124、149～173、174～192、201～225、372～393、398～429、446～469、470～494、495～518、519～541、543～566位氨基酸区;膜外区含8个N连接的糖基化位点.结论 本研究成功克隆巴马香猪TLR4基因,为进一步研究该基因的功能和蛋白质的特性奠定了基础.

关键词：猪、Toll样受体、生物信息学分析

所属期刊栏目：18

分类号：R349.64(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：广东海洋大学博士启动基金0712107

在线出版日期：2010-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：185-190,后插1