人乌头酸脱羧酶1基因及其编码蛋白的生物信息学分析

摘要：

目的 对人乌头酸脱羧酶1(aconitate decarboxylase 1,ACOD1)基因的转录调控因素及其编码蛋白的分子功能进行分析.方法 采用多种生物信息学软件对人ACODl基因启动子区域转录因子结合位点、甲基化CpG位点、单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,SNP)位点进行预测,对人ACOD1基因编码的蛋白进行GO(Gene Onotology)蛋白功能注释分析及蛋白互作网络分析.结果 人ACOD1基因启动子区域存在3个启动子序列,17个转录因子结合位点,无甲基化CpG位点,并存在12个SNP位点;人ACOD1蛋白具有多种分子功能并参与多种生物过程,可能与白细胞介素-1β(interleukin-1 beta,IL-iβ)、C-C 基序趋化因子-4(C-C motif chemokine-4,CCL-4)、干扰素调节因子 1(interferon regulatory factor 1,IRF1)和 C-X-C 基序趋化因子 10(C-X-C motif chemokine 10,CXCL10)等蛋白具有相互作用关系.结论 本文为进一步研究人ACOD1基因和蛋白的表达调控机制及生物功能提供参考,并有助于研究其在炎症反应、病原体感染等复杂疾病中的调控机制.

关键词：ACOD1基因、启动子、ACOD1蛋白、生物信息学

所属期刊栏目：35

分类号：Q811.4;R341(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金;湖南中医药大学中药学一流学科开放基金项目

在线出版日期：2022-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1178-1183