云南省柯萨奇病毒A组6型全基因组特征分析

摘要：

目的 分析2015年云南省4株柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)分离株的全基因组特征.方法 取手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿粪便样本,制备悬液,接种至人横纹肌肉瘤细胞,CV-A6致细胞病变(CPE)后,收集病毒液,提取RNA,经RT-PCR分段扩增获得全基因组片段,并进行测序.采用Geneious 9.1.4和Mega 7.0、Simplot等生物学软件进行核苷酸和氨基酸序列比对、系统进化及重组分析,并构建系统进化树.结果 4株CV-A6分离株之间核苷酸和氨基酸序列一致性分别为94.8％～97.9％和97.3％～98.4％,与近几年国内流行的CV-A6株核苷酸和氨基酸序列一致性分别为94.6％～97.9％和 97.4％～99.1％;分离株在5'UTR、2A、2C、3A、3D、3'UTR区可能存在与毒力和临床表型相关的12个位点.结论 4株云南分离株属于CV-A6血清型,为D3a基因亚型.

关键词：柯萨奇病毒A组6型、全基因组、序列分析

所属期刊栏目：35

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重大科技专项计划202002AA100009

在线出版日期：2022-09-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：922-927