2020-2021年冬季长春市水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析

摘要：

目的 分析2020-2021年冬季长春市水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)流行株的基因特征.方法 选择48例2020-2021年长春市水痘或带状疱疹患者为研究对象,制备疱疹液样本.提取VZV的DNA,以其为模板PCR扩增VZV基因组ORF22、ORF38、ORF54及ORF62特异性片段,并测序.将测序结果与各基因型VZV代表株的ORF22单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行比对;应用SnapGene软件寻找测序结果中ORF38-Pst Ⅰ、ORF54-Bgl Ⅰ和ORF62-Sma Ⅰ酶切位点,并与Oka株(Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+)进行比对.结果 48份疱疹液样本VZV基因ORF22-SNP位点碱基均与pOka株一致,为Clade2基因型.其中47份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,1份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,均为野毒株.结论 2020-2021年冬季长春市流行的VZV均为Clade2基因型的野毒株,且具有高度保守性.

关键词：水痘-带状疱疹病毒、基因型、开放阅读框、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：35

分类号：R373.1+2;R181.3+9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：吉林省与中国科学院科技合作高技术产业化专项资金项目2020SYHZO010

在线出版日期：2022-07-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：424-426,432