茶树Ⅲ类过氧化物酶基因家族的鉴定及表达模式分析

摘要：

目的 鉴定茶树中的Ⅲ类过氧化物酶(classⅢperoxidases,POD)基因家族成员,并分析其表达模式.方法 利用生物信息学方法鉴定茶树基因组中的POD基因家族成员,并检测其染色体定位、基因结构、蛋白质保守基序、进化关系及共线性关系;同时分析其在茶树不同组织中及经干旱胁迫、盐胁迫和冷胁迫后茶树中的转录组数据.结果 鉴定出茶树基因组中共有122个POD基因.122个茶树POD基因在茶树染色体上分布不均,并有较多串联基因重复序列;相同亚家族的基因结构和保守基序基本一致;根据进化关系茶树POD基因可分为5个簇;共存在23对共线性关系.茶树POD基因在根中呈高表达,部分基因随着叶片成熟度的增加,表达水平升高;不同的茶树POD基因在干旱胁迫、盐胁迫、冷胁迫后存在差异表达.结论 茶树POD基因在茶树生长发育和非生物胁迫响应中发挥重要作用,本实验为茶树POD基因功能的进一步研究奠定了基础.

关键词：茶树;Ⅲ类过氧化物酶基因;基因组;表达模式

所属期刊栏目：34

分类号：S571.1

资助基金：贵州省优秀青年科技人才培养计划;贵州省茶产业技术创新中心黔科中引地20174005;贵州省科技计划

在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1314-1319