猪源副流感病毒5型SH毒株全基因组测序及分析

摘要：

目的 对猪源副流感病毒5型(parainfluenza virus 5,PIV5) SH毒株进行全基因组测序及分析.方法 根据GenBank中登录的猪源PIV5基因组序列设计10对引物,采用RT-PCR法对各片段进行扩增、测序,并对获得的PIV5-SH株全基因组序列进行遗传进化性分析.结果 PIV5-SH毒株基因组长15246 nt,与传统毒株PIV5-W3A核苷酸序列同源性为98.7％.基于全基因组构建的遗传进化树显示,PIV5-SH毒株与韩国犬源PIV5(1168-1)、中国孟加拉虎源PIV5 (PIV5-HMZ)、中国东北虎源PIV5(PIV5-SR)及中国小熊猫源PIV5(ZJQ-221)具有较近的亲缘关系,与传统毒株W3A亲缘关系较远.进一步以PIV5 NP、F及HN基因构建遗传进化树显示,PIV5-SH毒株与PIV51168-1、PIV5-HMZ、PIV5-SR、PIV5 ZIQ-221和PIV5-CAN毒株亲缘关系近.结论 PIV5不同分离株基因差异较小,表现出一定的遗传稳定性.

关键词：副流感病毒5型;全基因组;遗传进化分析

所属期刊栏目：34

分类号：S855.3+2(动物医学（兽医学）)

资助基金："十三五"国家重点研发计划子任务;黑龙江省杰出青年科学基金项目;黑龙江省博士后科研启动基金项目;黑龙江八一农垦大学猪病防制创新团队支持计划

在线出版日期：2021-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1033-1038