半巢式多重PCR法对A组轮状病毒VP7基因的分型

摘要：

目的 采用半巢式多重PCR法对A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)VP7基因进行分型.方法 根据GenBank中RVA VP7基因5'端保守区设计合成多组基因分型引物,提取11个RVA代表流行毒株病毒的RNA,采用半巢式多重PCR方法进行RVA的VP7基因分型,使用BLAST在线软件与GenBank上相应VP7核苷酸序列比对.结果 经琼脂糖凝胶电泳鉴定,11株RVA的多重PCR产物大小均与预期一致,能正确鉴别具有代表性的流行毒株VP7基因型[G1、G2、KN105(Wa-like G3)、To16-01(equine-like,DS-1-likeG3)、G4、G8、G9及G12];经BLAST在线软件比对,RVA病毒株VP7基因序列与设计的上游引物匹配,并与下游引物互补,引物特异性良好.结论 利用设计的引物成功建立的半巢式多重PCR方法能正确识别RVA的VP7基因型.

关键词：轮状病毒、VP7基因型、半巢式多重PCR、引物设计

所属期刊栏目：34

分类号：R311(医用一般科学)

资助基金：国家重点研发计划项目2017YFD0501600

在线出版日期：2021-03-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：213-215