2018年湖南省登革病毒2型分离株非结构蛋白1基因的鉴定及分析
目的 鉴定并分析2018年湖南省登革病毒2型(dengue virus 2,DENV-2)分离株的非结构蛋白1(non-struc-tural protein 1,NS1)基因.方法 利用试剂盒提取登革热患者血清RNA,RT-PCR法鉴定病毒类型及扩增11株分离株NS1基因,并进行基因测序.应用MEGA 7.0软件分析分离株与DENV-2标准株(KM204118)的NS1基因核苷酸及氨基酸序列,利用最大似然法(1000 Boot strap replicate)构建NS1基因的系统进化树.结果 共获得11株分离株的NS1基因,经比对发现,除分离株HNNS201804和HNNS201810外,其余分离株在NS1基因第585位碱基由T变为C(无义突变);HNNS201806的NS1基因第936位碱基由C变为T(无义突变).11株分离株NS1基因其他突变位点均相同,共68处发生碱基突变,其中9个为有义突变.11株分离株与China-ZJ(2017-MH110594)、China-GZ(2018-MK564485、2015-KX621245、2017-MK564483)、Thailand(2017-LC410191)、Singapore(2016-MF314189)、Philippines(2015-KU517847)有较近的亲缘关系.结论 2018年湖南省11株分离株均为DENV-2,可能是浙江或广州输入株,也可能是泰国、新加坡和菲律宾等东南亚国家的输入株.
登革病毒2型、NS1基因、基因突变、系统进化树
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R373.3+3;Q789(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
云南省自然科学基金2016FA029
2021-02-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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