分离自手足口病和疱疹性咽峡炎患者的柯萨奇病毒A组10型病毒的基因特征及差异分析
目的 比较2株分离自手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)和疱疹性咽峡炎(herpangina,HA)患者粪便样品中的柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A 10,CA10)全基因组差异及基因特征,探讨基因突变可能导致的临床症状差异.方法 收集昆明市儿童医院经实时荧光定量PCR检测结果为CA10阳性的HFMD及HA患者粪便样品,在敏感细胞人横纹肌瘤细胞(rhabdomyoma,RD)上培养并分离出CA10.设计特异性引物扩增获得CA10全基因序列,通过BioEdit软件比较分离自HFMD及HA患者的CA10基因序列核苷酸与编码氨基酸之间的差异.从NCBI基因库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)中下载CA10 VP1基因序列作为参考序列,系统进化树分析分离获得的昆明CA10流行株的进化情况及来源.结果 分离自HFMD和HA患者的CA10-HFMD和CA10-HA的VP1区域核苷酸同源性为99.1％,氨基酸同源性为99.8％,且存在2个非同义突变位点;全基因序列核苷酸同源性为98.9％,编码区氨基酸同源性为99.5％,且存在12个非同义突变位点.系统进化分析表明2个昆明CA10分离株均位于G基因谱系,且与KF999765(北京)和JX473455(深圳)株亲缘关系最近.结论 来源于HFMD和HA患者的CA10分离株在核苷酸和氨基酸水平上相似性较高,且属于同一基因谱系.基因突变导致的氨基酸变异可能影响病毒的毒力从而导致患者症状的差异.
柯萨奇病毒A组10型、手足口病、疱疹性咽峡炎、进化分析、基因序列
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R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
云南省教育厅科学研究基金项目;云南省儿科临床疾病医学中心科技项目;昆明市卫生科技人才培养项目暨“十百千“工程内设研究机构,昆明市儿童罕见病诊断与家系基因测序研究中心;昆明市科技计划项目;中国医学科学院创新工程项目
2020-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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