奶牛microRNA-205靶基因及调控网络的精细预测分析
目的 预测奶牛microRNA-205(bta-miR-205)候选靶基因,对其进行生物信息学精细分析,构建候选靶基因参与的调控网络.方法 应用miRBASE、Targetscan和miRWalk软件预测其候选靶基因,经Gene Ontology、Panther、STRING和DAVID软件进行功能注释、分类统计、蛋白质互作及KEGG通路注释和富集分析,通过Cytoscape软件绘制靶基因可能重点参与的调控网络.结果 miR-205基因成熟区序列高度保守,共筛选出288个bta-miR-205候选靶基因,其参与的主要生物进程是细胞过程、代谢过程和生物调控,主要参与形成细胞器等细胞组分,主要分子功能是结合、催化作用.MAPK3等多个候选靶基因存在基因共表达和蛋白互作关系,参与免疫系统、适应性免疫系统、基因表达(转录)、抗原加工等反应途径显著富集在鞘脂、甲状腺激素、PI3K-Akt等信号通路.结论 bta-miR-205的候选靶基因MAPK3等可能通过参与免疫系统、基因表达(转录)、抗原加工等反应途径及鞘脂、甲状腺激素、PI3K-Akt等信号通路,在奶牛炎症疾病抗性、生殖及发育过程调控中发挥重要作用.
奶牛microRNA-205、靶基因预测、调控网络、信号通路
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S852.2(动物医学（兽医学）)
国家自然科学基金31472249,31772562;中国博士后科学基金项目2018M631970;黑龙江省博士后启动基金项目LBH-Z16166;黑龙江省教育厅科学技术研究项目12521365;黑龙江八一农垦大学校青年创新人才项目CXRC-2016-06;黑龙江省牛病防制重点实验室开放课题PCBD201708;黑龙江八一农垦大学博士启动基金项目XDB-2017-06
2019-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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