人呼吸道合胞病毒兰州株全基因组序列测定及分析

摘要：

目的 为了解人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytium virus,HRSV)兰州株(HRSV LZ01/09)的遗传特征及分子进化规律,进一步丰富RSV基因组数据库,对HRSV LZ01/09的全基因组序列进行测定及分析.方法 通过RT-PCR法对HRSV LZ01/09全基因组片段进行扩增及序列测定,利用分子生物学软件对测序结果进行拼接,并与GenBank登录的RSV实验参比株和各基因型代表株进行分子进化分析.结果 HRSV LZ01/09全基因组全长为15 204 bp,基因组的结构为NS1-NS2-N-P-M-SH-G-F-M2-1-M2-2-L,与报道的RSV实验参比株相同;全基因组序列比对分析表明,HRSV LZ01/09兰州株基因组序列与RSV RSS2株的同源性最高,为96.7％,与其他RSV-A亚型毒株同源性次之,为94.9％～95.2％,与RSV-B亚型9320株同源性最低,为80.9％;依据RSV-G基因的第2个可变区进行系统进化树分析,HRSV LZ01/09兰州株基因组与NA1病毒分离株属于同一个分支.结论 HRSV LZ01/09兰州株病毒基因组具有RSV的遗传特征,属于RSV-A亚型,基因型属于NA1型.

关键词：呼吸道合胞病毒、全基因组序列测定、同源性、系统进化树分析

所属期刊栏目：32

分类号：R373.1;Q789(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2019-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：735-741