辽宁省2014～2018年流行的水痘-带状疱疹病毒基因型别分析

摘要：

目的 分析2014年以来辽宁省流行的水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)基因型别,区分疫苗株与野毒株,为水痘防控奠定理论基础.方法 应用PCR法对VZV基因组第22个开放阅读框(open reading frame 22,ORF22)基因进行特异性扩增,并对PCR产物进行序列测定,结合单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)方法确定病毒的基因型别.扩增ORF38、ORF54、ORF62基因,测序后寻找目标片段中是否存在相应限制性酶切位点,以区分疫苗株与野毒株.结果 辽宁省2014～2018年共采集到68份临床诊断水痘病例的疱疹液样本,其中VZV-013-2015样本序列与DUMAS株一致,为Clade 1基因型,其余样本序列均为Clade 2基因型,与疫苗株Voka一致.辽宁省VZV分离株在69349位点Pst Ⅰ(+),95241位点Bgl Ⅰ(+),106262位点Sma Ⅰ(-).结论 Clade 2基因型为辽宁省VZV病毒流行优势基因型;辽宁省VZV均为野毒株感染.

关键词：水痘-带状疱疹病毒、单核苷酸多态性、基因型

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分类号：R373.1+2;R181.3+9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：辽宁及周边省市传染病病原谱流行规律研究2017ZX10-103007-001

在线出版日期：2019-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1348-1351