寨卡病毒亚洲型与非洲型基因同源性及重组分析
目的 分析寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)亚洲型与非洲型基因组核苷酸序列同源性及结构蛋白C、前膜蛋白(pre-membrane,prM)核苷酸和氨基酸序列差异,并探讨了ZIKV亚洲型和非洲型位点突变可能产生的后果.方法 在GenBank中登录的ZIKV亚洲型和非洲型序列中,分别选择5个不同的全长基因组序列,并获得其相应的氨基酸序列,采用BIOEDIT软件进行比对,分析相似度,统计不同型别间结构蛋白C、prM的核苷酸突变和氨基酸替代位点,并采用SimPlot软件分析两个型别间的同源重组.结果 ZIKV亚洲型与非洲型的核苷酸相似性在88.00％ ～ 89.00％之间;不同型别的结构蛋白C和prM碱基的突变比较显示,C基因共有19个碱基突变,prM基因共有48个碱基突变;氨基酸翻译比对显示,这67个碱基突变均为有效突变.两个型别结构蛋白C和prM编码的289个氨基酸中,占组成比例最多的均为亮氨酸(L),同源重组分析亚洲型与非洲型一致性较高,无重组信号.结论 通过对ZIKV亚洲型与非洲型的结构蛋白C、prM核苷酸序列、氨基酸的比较分析及同源重组分析,为研究ZIKV不同基因型间的生物学和致病性差异提供参考.
寨卡病毒、亚洲型、非洲型、C蛋白、前膜蛋白、氨基酸序列
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R373.9;Q789(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
国家十二五重大新药创新科技重大专项2012ZX09104302;国家自然科学基金面上项目81171946;云南省科技厅应用基础重点项目2016FA029;云南省科技厅联合支持国家科技计划项目2013GA018;中国医学科学院创新工程项目2016-I2M-1-19;云南自然科学基金项目2012FB188
2019-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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