吉林省2016年手足口病患儿肠道病毒71型VP1编码区基因分析

摘要：

目的 分析吉林省2016年肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)流行株基因学特征及其变异情况.方法 采集2016年吉林省9个市、州送检的临床诊断为手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)298份标本,分离病毒获得阳性分离物,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增阳性分离物VP1编码区,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,应用Mega6和Bioedit 7.01软件分析扩增序列基因亲缘关系和氨基酸位点变异.结果 吉林省2016年分离的38株EV71同属于C4a基因亚型,并在VP1编码区共发生7处氨基酸位点的变异.结论 吉林省2016年EV71流行株与C4a代表株位于同一分支属于C4a基因亚型,且发生了多位点氨基酸变异.

关键词：手足口病、肠道病毒71型、氨基酸位点、变异、C4a基因亚型

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分类号：R373.2;Q789(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家科学技术艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项传染病监测技术平台项目“辽宁及周边省市传染病病原谱流行规律研究”课题子课题“吉林省传染病病原谱流行规律研究”2012ZX10004209-003;吉林省手足口病病原谱分析2017J028

在线出版日期：2018-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1215-1218