奶牛miR-124a靶基因预测及生物信息学分析
目的 预测奶牛miR-124a(bta-miR-124a)的靶基因,并对其生物学功能、调控机制以及参与的信号转导通路进行富集分析,为bta-miR-124a调控乳品质代谢的功能验证研究提供理论依据.方法 利用miRBase、miRWalk和Targetscan等在线数据分析系统,获得bta-miR-124a的前体及成熟区序列,同时预测其候选靶基因并取交集,进而对筛选获得的候选靶基因进行GO功能注释及信号通路富集分析.结果 bta-miR-124a序列在各物种间高度保守,其候选靶基因主要富集在生物调控、细胞生长、代谢等生物学过程中.KEGG信号通路显示,在癌症、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、单磷酸腺苷活化蛋白激酶(AMP-activated protein,AMPK)、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号转导、脂肪酸降解、脂肪酸生物合成等信号通路中,候选靶基因均被富集.结论 bta-miR-124a的候选靶基因在癌症发生、AMPK信号转导、脂肪酸代谢中发挥重要作用.其中,脂肪酸代谢是bta-miR-124a可能参与的主要代谢调控通路.为后期bta-miR-124a在奶牛乳腺组织中调控乳脂代谢的功能机制的研究提供参考.
miR-124a、靶基因预测、生物信息学分析、乳脂代谢、奶牛
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Q31(遗传与变异)
中国博士后科学基金项目2018M631970;黑龙江省博士后启动基金项目LBH-Z16166;黑龙江省教育厅科学技术研究项目12521365;校青年创新人才项目CXRC-2016-06;黑龙江省牛病防制重点实验室开放课题PCBD201708;黑龙江八一农垦大学博士启动基金项目XDB-2017-06
2018-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
1084-1089,1094
