吉林省2011年手足口病死亡病例肠道病毒71型分离株全基因组基因特征分析

摘要：

目的 分析吉林省2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)死亡病例标本中分离获得的肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)毒株全基因组基因特征.方法 采用分段RT-PCR法对2011年吉林省HFMD死亡病例EV71分离株JL2011-56全基因组进行扩增和测序.利用Clustal X2和MEGA5软件构建分离株JL2011-56与GenBank中27株参考株的全基因组序列和VP1区全基因组序列的进化树,分析J12011-56株的流行病学特征;同时与GenBank中12株C4a基因亚型参考株进行全基因组核苷酸和氨基酸序列的同源性分析.结果 JL2011-56分离株属于C4a亚型,核苷酸序列和氨基酸序列与山东分离株SDLY107(JX244186.1)同源性最高,分别为99.2％和99.5％,与EV71原型株BrCr的同源性分别为79.9％和95.7％.结论 JL2011-56分离株与山东株亲缘关系较近,可能存在共同的与中枢神经毒力相关的氨基酸突变位点.

关键词：手足口病、肠道病毒71型、全基因组

所属期刊栏目：30

分类号：R373.2;Q789(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：吉林省人社厅2010年度留学回国人员科技创新创业项目2010-27;国家科学技术艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项传染病监测技术平台项目2012ZX10004209-003

在线出版日期：2017-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1146-1149