云南大理某农村猪星状病毒分子流行病学调查

摘要：

目的 了解云南大理某农村猪群中星状病毒(astrovirus,AstV)感染情况,为AstV的防控提供理论依据.方法 利用逆转录巢式聚合酶链反应(RT-nested PCR)技术,对云南大理某农村采集的42份猪粪便样品进行PAstV799 bp基因部分片段扩增、克隆,并测序;利用NCBI BLAST进行数据库比对,Mega 4.1软件进行序列同源性比较和系统进化树构建.结果 Trizol试剂提取42份猪粪便样品上清总RNA,经RT-nested PCR扩增,5份样品可见799 bp的目的基因片段,阳性率为11.90％;PAstV 799 bp片段同源性分析显示,5个毒株与PAstV-1、2、3、4和5的同源性为46.3％ ～ 87.9％,与PAstV-4的同源性最高,为75.5％ ～ 87.9％;PAstV 799 bp片段的系统进化分析显示,分离的毒株属于PAstV-4,同源性为80.0％～ 99.5％.结论 云南省PAstV-4流行病学调查将有利于中国AstV的预防及治疗.

关键词：猪星状病毒、逆转录巢式聚合酶链反应、流行病学

所属期刊栏目：30

分类号：S852.65+9.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：云南省卫生科技计划项目2014NS234,2014NS233,2014NS365,2014NS366;云南省科技惠民谋划2014RA019

在线出版日期：2017-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：596-599,606