我国鼠诺如病毒的分离培养及其基因组序列分析
目的 分离我国鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)(命名SH1603),并进行基因组序列测定和分析.方法 利用RAW264.7细胞分离MNV SH1603,参考国外已发表的MNV4(DQ223043)基因组序列设计引物,经重叠的反转录PCR扩增全基因组,利用生物信息学软件对全基因组序列进行分析.结果 MNV SH1603引起RAW264.7细胞病变,其基因组全长7 238个核苷酸,包括4个开放阅读框(open reading frames,ORF),预测的ORF1、ORF2、ORF3、ORF4编码蛋白大小分别为186 000、58 000、22 000和23 000,其中ORF1和ORF2之间有14个核苷酸重叠,ORF2和ORF3之间有1个核苷酸重叠,ORF4包含在ORF2中.NCBI Blast比对发现,SH1603基因组与MNV4同源性最高(94％).衣壳蛋白区的进化分析发现,SH1603与MNV4(DQ223043)和Berlin0606(EF531291)亲缘关系最近.衣壳蛋白区氨基酸比对发现,SH 1603与MNV4比较,有4个位点突变,分别为aa211S→A、aa358I→V、aa404E→L、aa534V→A.结论 已分离到1株MNV,与国外报道的MNV4具有高度的进化亲源关系,为我国进一步研究MNV流行和致病机制奠定了基础.
鼠诺如病毒、病毒分离培养、全基因组分析
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R373.2;Q789(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
国家自然科学基金81601813
2017-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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