一株柯萨奇病毒A9分离株的VP1基因遗传特征分析

摘要：

目的 分析引起病毒性脑炎(viral encephalitis,VE)的一株柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)A9分离株(CVA9)的VP1基因遗传特征.方法 采用KMB17细胞对VE患儿粪便标本进行病毒分离,利用RT-PCR法从分离的病毒中扩增VP1全基因,并测序,采用Mega6.1和Geneious 5.6.5等软件分析其序列,并构建系统进化树.结果 从5份VE患儿粪便中分离到一株人CVA9,命名为A108/YN/CHN/2009,其全长VP1基因的核苷酸长度与其他CVA9一致,均为906 bp.与中国其他分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为88.4％ ～ 98.2％和96.4％ ～ 99.3％,而与国外分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.0％ ～ 96.0％和92.7％ ～ 99.0％.在进化树上与其他中国分离株属同一分支中不同两个亚分支,与JB141230009亲缘关系较近.结论 A108/YN/CHN/2009分离株为肠道病毒CVA9血清型,与其他中国分离株同属一个基因簇.

关键词：柯萨奇病毒A9、VP1基因、遗传特征

所属期刊栏目：29

分类号：R373.2+3;Q75(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：云南省应用基础研究项目2013FZ136.

在线出版日期：2016-03-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：18-22