森林脑炎病毒Vero细胞适应株的全基因组序列分析

摘要：

目的 对森林脑炎病毒(tick-borne encephalitis virus,TBEV)森“张”株在Vero细胞上的适应株(以下称SZV株)进行全基因组测序,并与TBEV远东亚型的其他毒株、欧洲亚型毒株进行比较.方法 设计TBEV的特异性引物,提取SZV株病毒总RNA,以其为模板,采用RT-PCR方法分段扩增序列并测序,应用Vector NTI 9.0软件进行拼接,并与森“张”株、GenBank中报道的TBEV远东亚型Oshima 5-10株、Sofjin-HO株及欧洲亚型263株、Neudoerfl株的全长基因序列进行比对分析.结果 SZV株的全基因组由10 782个核苷酸组成,仅编码1个开放阅读框,长度为10 245个核苷酸,共编码3 414个氨基酸.SZV株与TBEV远东亚型的Oshima5-10株和Sofjin-HO株ORF区编码的氨基酸序列同源性分别为95.0％和94.6％,与TBEV欧洲亚型的典型毒株263株和Neudoerfl株ORF区编码的氨基酸序列同源性分别为91.1％和91.0％.结论 对TBEV Vero细胞适应株SZV进行了全基因组序列测定及分析,为研制基于Vero细胞基质的森林脑炎疫苗奠定了基础.

关键词：森林脑炎病毒、Vero细胞、序列分析

所属期刊栏目：28

分类号：R373.3+1;Q71(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家科技部重大新药创制项目2013ZX09402302-205.

在线出版日期：2015-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：553-556