一株柯萨奇病毒B2分离株的VP1基因序列特征分析

摘要：

目的 分析一株柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)B2分离株(CVB2)全VP1基因序列特征.方法 用RD细胞对10份HFMD疑似患儿的粪便标本进行病毒分离,利用RT-PCR法从分离的病毒中扩增VP1基因,并测序,采用NCBI BLAST、Mega 6.1和Geneious等软件进行序列分析,并构建系统进化树.结果 从10份HFMD疑似患儿粪便中分离到一株CVB2,命名为509/YN/CHN/2010,其全长VP1基因的核苷酸长度与其他CVB2一致,均为846 bp.与中国其他分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.0％ ～ 95.3％和97.9％～98.9％,而与国外分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.1％ ～ 87.8％和97.9％ ～ 98.6％.在进化树上与其他中国分离株分属不同的两个分支,而与M10MG17亲缘关系较近.结论 509/YN/CHN/2010分离株为肠道病毒CVB2,为两个中国分支中的一支.

关键词：柯萨奇病毒B2、VP1基因、序列分析

所属期刊栏目：28

分类号：R373.2+3;Q78(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：云南省应用基础研究项目2013FZ136.

在线出版日期：2015-03-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：49-53