埃可病毒9型分离株MSH-KM812 VP1基因的遗传特征
目的 分析2010年昆明市引起手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原埃可病毒9型(Echo virus 9,E9)分离株MSH-KM812 VP1基因的遗传特征.方法 分别采用RD细胞和Hep-2细胞对3份HFMD患儿粪便标本进行病毒分离,应用RT-PCR法分2段扩增病毒VP1基因,并进行序列测定.应用NCBI BLAST软件对所测定的节段序列进行比对；Omiga软件对所测定的节段序列的核苷酸及推导的氨基酸序列进行编辑、比对和拼接；应用Mega 5.05软件进行序列分析,并与15个E9参考株的VP1基因序列进行比较,构建基因系统进化树.结果 从3份HFMD患儿粪便标本中分离到1株E9,命名为MSH-KM812,其VP1区的核苷酸长度为888 bp.MSH-KM812株与其他15个E9参考株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78.6％ ～ 98.0％和87.5％ ～ 99.3％,与中国分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.7％～98.0％和97.0％ ～ 99.3％,其中与中国江苏分离株M10MF37 China 2010核苷酸和氨基酸序列同源性最高,分别为98.0％和99.3％,而与德国分离株Hill的核苷酸和氨基酸序列同源性最低,分别为78.6％和87.5％.基因进化树分析显示,MSH-KM812分离株与中国江苏分离株M10MF37 China 2010和中国山东分离株05189-SD-CHN-2005-E9属于同一个进化分枝.结论 MSH-KM812分离株为E9,与中国其他分离株同属一个进化分枝.
埃可病毒9型、VP1基因、序列分析
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R373.1+1;Q78(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
2013-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共4页
346-348,353
