33株柯萨奇病毒A组16型分离株的全基因序列分析

摘要：

目的 对2008～2010年北京和青岛地区流行的33株柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie virus A16,CA16)分离株的全基因序列进行分析.方法 收集2008 ～ 2010年北京和青岛地区CA16感染患者咽拭子标本,采用Vero细胞对病毒进行分离,并经噬斑纯化.提取病毒RNA,采用RT-PCR法分段扩增CA16全长基因,经序列测定和拼接后,利用DNAStar和MEGA5.10软件分析全基因序列.结果 经病毒分离和噬斑纯化,共获得33株CA16分离株；33个分离株之间的核苷酸序列同源性大于90.9％,与CA16国际标准株G10各区段的核苷酸序列同源性为72.7％～89.0％,氨基酸序列同源性为79.3％～100.0％；与近年中国分离的CA16 SZ/HK08-7株同源性较高,全基因组同源性大于91.5％,各区段核苷酸序列同源性均大于83.7％；在基于VP1序列的种系进化树中,BJWG16、BJWG17、BJWG20等23个分离株属于C1亚型,其余10个分离株属于C3亚型.结论 2008 ～ 2010年北京和青岛地区流行的33株CA16分离株均为C基因型.本研究对我国CA16分子流行病学、毒力位点的研究以及疫苗株的选择具有重要意义.

关键词：柯萨奇病毒A组16型、全基因组、序列分析

所属期刊栏目：26

分类号：R373.2+3;Q78(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2013-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：309-314,323