猪附红细胞体ORF2蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位的预测

摘要：

目的 预测猪附红细胞体[亦称猪嗜血支原体(Mycoplasma suis,M.suis)]ORF2基因编码蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位.方法 应用生物信息学软件DNAstar的Editseq将M.suis中ORF2的基因核苷酸序列翻译成氨基酸序列,与GenBank中登录的氨基酸序列进行比对,通过Protean模块预测ORF2蛋白的二级结构及其亲水性区域、柔韧性区域、抗原指数、表面可及性等特性,并预测B细胞优势抗原表位.结果 ORF2蛋白具有规则的二级结构,多处于亲水性区域、柔韧性区域、表面可及性较大和抗原指数较高的区段,潜在的优势B细胞抗原表位为17～23、121 ～ 127、138 ～ 144、192 ～ 200氨基酸区段.结论 预测了ORF2蛋白二级结构和B细胞抗原表位,为M.suis 表位疫苗的设计以及血清诊断试剂盒的研发奠定了理论基础.

关键词：猪附红细胞体、生物信息学、二级结构、B细胞抗原表位

所属期刊栏目：26

分类号：R518.1;R392.12(传染病)

资助基金：辽宁省科技基金资助项目2006408002-6

在线出版日期：2013-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：218-221