人白细胞介素-29的生物信息学分析

摘要：

目的 利用生物信息学技术对人白细胞介素-29(Human nterleukin-29,IL-29)进行分析,为定点突变hIL-29,以提高其生物学活性奠定理论基础.方法 利用生物信息学技术分析克隆得到的hIL-29基因,预测hIL-29基因编码蛋白的理化性质、结构、功能及可能影响其生物学活性的关键氨基酸位点；预测其三维结构,并与IFNλ3的晶体结构进行比对；对检索到的9个物种的IL-29基因同源序列进行比对,并构建系统进化树.结果 hIL-29基因编码蛋白含200个氨基酸残基,其N-末端19个氨基酸为信号肽,成熟肽的相对分子质量为20 018,理论等电点为9.08,肽链中含一个由胞内向胞外的跨膜结构域；hIL-29的空间构象由6个α螺旋(A～F)和无规则卷曲组成,螺旋A、B和F可能是hIL-29与特异性受体结合而发挥生物学效应的活性部位,A、F螺旋中有4个氨基酸残基可能是影响其生物学活性的关键氨基酸位点；系统进化分析显示,hIL-29与狗、猫、大熊猫、马、野猪、黑猩猩、长臂猿的IL-29具有较高的同源性,处于同一个大分枝,而人、黑猩猩、长臂猿的IL-29处于同一个小分枝,在系统进化树中的距离最近.结论 关键位点氨基酸的差异可能对hIL-29的生物学活性影响较大,可作为对hIL-29进行分子改造的突变位点.本研究为后续进行hIL-29的定向改构及其构效关系等的深入研究奠定了理论基础.

关键词：白细胞介素-29、生物信息学、突变

所属期刊栏目：26

分类号：R392.11;R318.04

在线出版日期：2013-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：209-212,217