风疹病毒松叶株全基因序列测定与分析

摘要：

目的:对我国现用风疹病毒(Rubella virus,RV)疫苗生产毒株松叶株(Matsuba)进行全基因组测序,分析其在减毒过程中的遗传与变异特点,为其安全性评价及遗传学质量控制的标准化提供依据.方法:利用RT-PCR法分段扩增我国现用Matsuba疫苗株主代种子基因组全序列,分别将产物插入到T-A克隆载体pGEM-T easy中,构建病毒cDNA文库,进行全基因组序列测定与分析.结果:我国现用Matsuba疫苗株主代种子基因组全长9762nt,含2个ORF,分别位于核苷酸41～6388位和6512～9700位,编码2116、1062个氨基酸；与GenBank中登录的Matsuba.GMK3野毒株和Matsuba疫苗株核苷酸同源性分别为97.5％和99.9％,氨基酸同源性分别为98.8％和99.9％；其在减毒的过程中共有37个氨基酸位点发生变异,其中非结构蛋白P150有18个氨基酸位点发生突变,结构:蛋白El和E2主要抗原位点氨基酸末发生变异,E1-177位糖基化位点突变丢失.结论:我国现用风疹病毒Matsuba疫苗株与同类减毒株具有较高的同源性,其主要的抗原位点在减毒保种过程中高度保守,为在分子水平上保证Matsuba株毒种及其生产疫苗的安全性提供了依据.

关键词：风疹病毒、松叶株、基因组、序列分析

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分类号：R373.1+1;Q78(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金："十一五"国家科技支撑计划2008BA154B03

在线出版日期：2012-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：525-528