申克孢子丝菌双相转换差异表达基因的生物信息学分析

摘要：

目的 探讨申克孢子丝菌菌丝相( Mycelium,M)和酵母相(Yeast,Y)双相转换的分子机制,筛选与其双相转换相关的差异表达基因.方法 应用抑制性消减杂交技术,构建申克孢子丝菌菌丝相和酵母相的正反cDNA消减文库,并对其差异表达的基因进行生物信息学分析.结果 M+Y文库获得751条表达序列标签(Expressed sequence tags,ESTs),经拼接后获得101条非冗余序列(Unigenes)；Y+M文库获得875条ESTs,拼接获得249条Unigenes.申克孢子丝菌酵母相和菌丝相的转换伴随着不同菌相细胞差异基因的高表达,这些高表达的差异基因可分为结构基因类、代谢酶类、细胞表面分子类及功能不明的细胞分子.结论 已成功构建申克孢子丝菌双相转换相关的cDNA消减文库,并筛选出部分差异表达基因,为进一步研究申克孢子丝菌致病相关基因奠定了基础.

关键词：申克孢子丝菌、抑制性消减杂交、基因文库、生物信息学分析

所属期刊栏目：24

分类号：R379.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：重庆市卫生局科学基金2008-2-73

在线出版日期：2011-12-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1022-1027