麻疹病毒属病毒种特异性探针的设计

摘要：

目的 设计能检测麻疹病毒、犬瘟热病毒、牛瘟病毒、海豹瘟热病毒、海豚瘟热病毒和小反刍兽疫病毒的基因芯片探针,制备芯片用于以上病毒的种特异性检测.方法 在ncbi网站下载上述病毒全部基因组序列信息,利用生物学软件CLUSTAL W对从GenBank中获得的6种病毒所有序列进行比对,获得每种病毒有意义的特异序列,以此作为设计oligo探针的备选序列,利用生物软件Primer Premier 5.0设计探针.选择最优化探针,制备基因芯片,并进行特异性验证.结果 获得6条长度均一,退火温度相近,特异性良好的种特异性寡核苷酸探针.结论 利用GenBank数据库和生物学软件Primer Premier 5.0设计病毒检测基因芯片探针,是一种快速、有效的方法.

关键词：麻疹病毒属、种特异性、探针、基因芯片

所属期刊栏目：23

分类号：Q78;R373.1+1(基因工程（遗传工程）)

资助基金：军队医药卫生科研基金06G138

在线出版日期：2010-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1132-1134